金堂县疾病预防控制中心为二级甲等疾控机构，2025年6月重新组建金堂县疾病预防控制中心，挂金堂县卫生监督所牌子，为公益一类事业单位（县农村饮水安全水质检测中心挂靠县疾控中心运行），位于赵镇街道迎宾大道一段17号。中心成立于2005年1月，其前身为金堂县卫生防疫站。中心为全县疾病预防控制、健康教育、健康促进的业务指导中心，以及全县重大污染、重大中毒、重大疫情、重大灾害等突发事件实行危机管理的技术中心，承担全县公共卫生、医疗卫生等监督执法工作。中心办公楼占地面积为2231.5平方米，建筑面积4440平方米。内设办公室、财务科、质量与应急管理科、后勤综合科、重大传染病防制科、急性传染病防制科、免疫规划科、慢病及健康教育科、检验科、公共卫生监测与监督科、职业卫生监测与监督科、医疗卫生监督科12个科室筹备组。现有职工111人，其中参公人员11人、专业技术人员85人（高级职称18人，中级职称33人，初级职称34人）。中心建有艾滋病检测CD4细胞实验室、分子生物学实验室、艾滋病病毒（HIV）初筛实验室等专用实验室，有原子吸收仪、气相色谱仪、离子色谱仪、流式细胞仪、PCR实时荧光和核酸提取仪等大型设备，市级B类设备达到317台件，能够开展401项检验检测项目。
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